Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VDRP11473 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VDRP11473 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VDRP11473 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VDRP11473 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VDRP11473 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VDRP11473 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VDRP11473 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VDRP11473 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VDRP11473 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VDRP11473 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VDRP11473 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VDRP11473 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VDRP11473 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VDRP11473 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VDRP11473 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VDRP11473 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VDRP11473 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VDRP11473 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VDRP11473 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VDRP11473 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VDRP11473 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VDRP11473 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VDRP11473 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VDRP11473 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VDRP11473 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VDRP11473 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VDRP11473 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VDRP11473 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VDRP11473 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VDRP11473 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VDRP11473 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VDRP11473 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VDRP11473 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VDRP11473 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VDRP11473 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VDRP11473 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VDRP11473 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VDRP11473 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VDRP11473 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VDRP11473 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VDRP11473 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VDRP11473 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VDRP11473 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VDRP11473 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VDRP11473 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VDRP11473 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VDRP11473 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VDRP11473 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VDRP11473 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VDRP11473 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VDRP11473 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VDRP11473 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VDRP11473 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VDRP11473 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VDRP11473 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VDRP11473 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VDRP11473 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VDRP11473 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VDRP11473 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VDRP11473 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VDRP11473 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VDRP11473 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VDRP11473 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VDRP11473 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VDRP11473 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VDRP11473 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VDRP11473 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VDRP11473 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VDRP11473 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VDRP11473 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VDRP11473 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VDRP11473 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VDRP11473 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VDRP11473 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VDRP11473 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VDRP11473 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VDRP11473 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VDRP11473 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VDRP11473 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VDRP11473 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VDRP11473 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VDRP11473 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VDRP11473 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VDRP11473 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VDRP11473 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VDRP11473 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VDRP11473 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VDRP11473 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VDRP11473 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VDRP11473 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VDRP11473 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VDRP11473 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VDRP11473 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VDRP11473 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VDRP11473 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VDRP11473 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VDRP11473 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VDRP11473 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VDRP11473 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms