Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAMP11215 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGAMP11215 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms