Protein–RNA interactions for Protein: P10619

CTSA, Lysosomal protective protein, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSAP10619 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSAP10619 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSAP10619 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSAP10619 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSAP10619 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSAP10619 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSAP10619 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSAP10619 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSAP10619 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSAP10619 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSAP10619 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSAP10619 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSAP10619 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSAP10619 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSAP10619 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSAP10619 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSAP10619 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSAP10619 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSAP10619 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSAP10619 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTSAP10619 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSAP10619 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSAP10619 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSAP10619 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSAP10619 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSAP10619 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSAP10619 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSAP10619 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSAP10619 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSAP10619 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSAP10619 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSAP10619 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSAP10619 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSAP10619 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSAP10619 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSAP10619 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSAP10619 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSAP10619 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSAP10619 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSAP10619 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSAP10619 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSAP10619 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSAP10619 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSAP10619 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSAP10619 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSAP10619 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSAP10619 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSAP10619 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSAP10619 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSAP10619 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSAP10619 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSAP10619 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSAP10619 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSAP10619 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSAP10619 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSAP10619 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSAP10619 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSAP10619 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSAP10619 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSAP10619 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSAP10619 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSAP10619 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSAP10619 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSAP10619 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSAP10619 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSAP10619 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSAP10619 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSAP10619 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSAP10619 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSAP10619 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSAP10619 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSAP10619 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSAP10619 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSAP10619 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSAP10619 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSAP10619 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSAP10619 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSAP10619 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSAP10619 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSAP10619 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSAP10619 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSAP10619 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSAP10619 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSAP10619 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSAP10619 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSAP10619 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSAP10619 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSAP10619 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSAP10619 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSAP10619 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSAP10619 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSAP10619 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSAP10619 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSAP10619 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTSAP10619 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSAP10619 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSAP10619 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSAP10619 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSAP10619 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSAP10619 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms