Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C8orf88P0DMB2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf88P0DMB2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms