Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC2BP0DI82 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC2BP0DI82 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms