Protein–RNA interactions for Protein: P09619

PDGFRB, Platelet-derived growth factor receptor beta, humanhuman

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Length 1,106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRBP09619 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDGFRBP09619 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
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