Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPLP06858 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPLP06858 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPLP06858 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LPLP06858 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LPLP06858 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
LPLP06858 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LPLP06858 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LPLP06858 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LPLP06858 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LPLP06858 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LPLP06858 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LPLP06858 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LPLP06858 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LPLP06858 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LPLP06858 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LPLP06858 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LPLP06858 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LPLP06858 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LPLP06858 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LPLP06858 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LPLP06858 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LPLP06858 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LPLP06858 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LPLP06858 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LPLP06858 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LPLP06858 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LPLP06858 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LPLP06858 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LPLP06858 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LPLP06858 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LPLP06858 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LPLP06858 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LPLP06858 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LPLP06858 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LPLP06858 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LPLP06858 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LPLP06858 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LPLP06858 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LPLP06858 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LPLP06858 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LPLP06858 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LPLP06858 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LPLP06858 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LPLP06858 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LPLP06858 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LPLP06858 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LPLP06858 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LPLP06858 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LPLP06858 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LPLP06858 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LPLP06858 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LPLP06858 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LPLP06858 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LPLP06858 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LPLP06858 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LPLP06858 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LPLP06858 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LPLP06858 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LPLP06858 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LPLP06858 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LPLP06858 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LPLP06858 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LPLP06858 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LPLP06858 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LPLP06858 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LPLP06858 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LPLP06858 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LPLP06858 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LPLP06858 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LPLP06858 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LPLP06858 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LPLP06858 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LPLP06858 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LPLP06858 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LPLP06858 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LPLP06858 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LPLP06858 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LPLP06858 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LPLP06858 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LPLP06858 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LPLP06858 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LPLP06858 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LPLP06858 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LPLP06858 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LPLP06858 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LPLP06858 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LPLP06858 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LPLP06858 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LPLP06858 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LPLP06858 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LPLP06858 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LPLP06858 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LPLP06858 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LPLP06858 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LPLP06858 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LPLP06858 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LPLP06858 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LPLP06858 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LPLP06858 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms