Protein–RNA interactions for Protein: P05496

ATP5G1, ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5G1P05496 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5G1P05496 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP5G1P05496 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5G1P05496 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5G1P05496 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms