Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFNA4P05014 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNA4P05014 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFNA4P05014 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms