Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYBBP04839 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYBBP04839 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYBBP04839 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYBBP04839 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYBBP04839 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYBBP04839 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYBBP04839 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYBBP04839 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYBBP04839 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYBBP04839 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYBBP04839 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYBBP04839 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYBBP04839 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYBBP04839 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYBBP04839 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYBBP04839 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYBBP04839 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CYBBP04839 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYBBP04839 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYBBP04839 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYBBP04839 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYBBP04839 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYBBP04839 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYBBP04839 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYBBP04839 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYBBP04839 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYBBP04839 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CYBBP04839 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYBBP04839 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYBBP04839 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYBBP04839 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYBBP04839 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYBBP04839 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYBBP04839 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYBBP04839 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYBBP04839 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYBBP04839 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CYBBP04839 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYBBP04839 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYBBP04839 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYBBP04839 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYBBP04839 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYBBP04839 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYBBP04839 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYBBP04839 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYBBP04839 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYBBP04839 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYBBP04839 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CYBBP04839 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYBBP04839 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYBBP04839 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYBBP04839 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYBBP04839 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYBBP04839 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYBBP04839 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYBBP04839 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYBBP04839 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYBBP04839 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYBBP04839 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYBBP04839 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYBBP04839 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYBBP04839 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYBBP04839 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYBBP04839 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CYBBP04839 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYBBP04839 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYBBP04839 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYBBP04839 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CYBBP04839 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYBBP04839 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYBBP04839 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYBBP04839 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYBBP04839 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYBBP04839 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYBBP04839 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYBBP04839 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYBBP04839 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYBBP04839 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYBBP04839 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYBBP04839 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYBBP04839 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYBBP04839 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYBBP04839 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYBBP04839 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYBBP04839 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYBBP04839 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYBBP04839 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CYBBP04839 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYBBP04839 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYBBP04839 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYBBP04839 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYBBP04839 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYBBP04839 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYBBP04839 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYBBP04839 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYBBP04839 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYBBP04839 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYBBP04839 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CYBBP04839 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms