Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOA1P02647 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOA1P02647 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOA1P02647 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOA1P02647 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOA1P02647 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA1P02647 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA1P02647 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA1P02647 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA1P02647 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA1P02647 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA1P02647 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA1P02647 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA1P02647 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA1P02647 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA1P02647 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA1P02647 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA1P02647 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA1P02647 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA1P02647 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA1P02647 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOA1P02647 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA1P02647 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA1P02647 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA1P02647 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA1P02647 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA1P02647 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA1P02647 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA1P02647 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA1P02647 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA1P02647 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOA1P02647 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA1P02647 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA1P02647 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA1P02647 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA1P02647 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA1P02647 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA1P02647 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA1P02647 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA1P02647 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA1P02647 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA1P02647 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA1P02647 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA1P02647 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA1P02647 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA1P02647 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOA1P02647 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOA1P02647 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOA1P02647 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOA1P02647 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOA1P02647 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOA1P02647 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOA1P02647 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOA1P02647 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOA1P02647 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOA1P02647 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOA1P02647 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOA1P02647 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOA1P02647 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOA1P02647 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOA1P02647 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOA1P02647 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOA1P02647 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOA1P02647 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOA1P02647 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOA1P02647 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOA1P02647 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOA1P02647 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOA1P02647 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOA1P02647 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOA1P02647 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOA1P02647 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOA1P02647 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOA1P02647 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOA1P02647 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOA1P02647 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOA1P02647 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOA1P02647 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOA1P02647 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOA1P02647 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOA1P02647 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOA1P02647 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOA1P02647 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOA1P02647 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOA1P02647 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOA1P02647 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOA1P02647 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOA1P02647 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOA1P02647 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOA1P02647 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOA1P02647 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOA1P02647 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOA1P02647 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOA1P02647 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOA1P02647 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOA1P02647 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOA1P02647 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA1P02647 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA1P02647 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA1P02647 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms