Protein–RNA interactions for Protein: P01772

IGHV3-33, Immunoglobulin heavy variable 3-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-33P01772 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms