Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNB1P01574 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNB1P01574 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms