Protein–RNA interactions for Protein: O95989

NUDT3, Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT3O95989 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUDT3O95989 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NUDT3O95989 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms