Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TTLL1O95922 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL1O95922 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms