Protein–RNA interactions for Protein: O95803

NDST3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST3O95803 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST3O95803 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST3O95803 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST3O95803 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST3O95803 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST3O95803 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST3O95803 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST3O95803 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST3O95803 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST3O95803 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST3O95803 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST3O95803 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST3O95803 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST3O95803 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST3O95803 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST3O95803 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST3O95803 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST3O95803 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST3O95803 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST3O95803 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST3O95803 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST3O95803 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST3O95803 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST3O95803 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST3O95803 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST3O95803 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST3O95803 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST3O95803 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST3O95803 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST3O95803 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST3O95803 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NDST3O95803 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NDST3O95803 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NDST3O95803 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST3O95803 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST3O95803 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST3O95803 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST3O95803 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST3O95803 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST3O95803 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST3O95803 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST3O95803 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST3O95803 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST3O95803 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST3O95803 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST3O95803 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST3O95803 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST3O95803 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST3O95803 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST3O95803 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST3O95803 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST3O95803 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST3O95803 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST3O95803 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST3O95803 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST3O95803 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST3O95803 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST3O95803 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST3O95803 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST3O95803 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST3O95803 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST3O95803 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST3O95803 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST3O95803 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST3O95803 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST3O95803 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST3O95803 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST3O95803 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST3O95803 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST3O95803 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST3O95803 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST3O95803 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST3O95803 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST3O95803 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST3O95803 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST3O95803 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST3O95803 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST3O95803 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST3O95803 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST3O95803 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST3O95803 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST3O95803 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST3O95803 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST3O95803 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST3O95803 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST3O95803 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST3O95803 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST3O95803 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST3O95803 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST3O95803 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST3O95803 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST3O95803 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST3O95803 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST3O95803 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST3O95803 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST3O95803 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST3O95803 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST3O95803 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST3O95803 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDST3O95803 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms