Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD1O95696 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD1O95696 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD1O95696 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD1O95696 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD1O95696 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD1O95696 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD1O95696 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD1O95696 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD1O95696 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD1O95696 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD1O95696 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD1O95696 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD1O95696 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BRD1O95696 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD1O95696 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD1O95696 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD1O95696 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD1O95696 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD1O95696 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD1O95696 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD1O95696 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD1O95696 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD1O95696 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD1O95696 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD1O95696 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD1O95696 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD1O95696 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD1O95696 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD1O95696 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD1O95696 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD1O95696 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD1O95696 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD1O95696 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD1O95696 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD1O95696 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD1O95696 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD1O95696 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD1O95696 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD1O95696 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD1O95696 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD1O95696 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD1O95696 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD1O95696 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRD1O95696 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRD1O95696 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRD1O95696 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRD1O95696 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRD1O95696 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRD1O95696 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRD1O95696 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRD1O95696 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRD1O95696 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRD1O95696 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRD1O95696 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRD1O95696 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRD1O95696 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRD1O95696 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRD1O95696 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRD1O95696 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRD1O95696 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRD1O95696 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRD1O95696 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRD1O95696 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRD1O95696 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRD1O95696 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRD1O95696 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRD1O95696 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRD1O95696 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRD1O95696 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRD1O95696 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BRD1O95696 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BRD1O95696 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRD1O95696 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRD1O95696 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRD1O95696 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRD1O95696 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRD1O95696 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRD1O95696 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRD1O95696 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRD1O95696 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRD1O95696 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRD1O95696 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRD1O95696 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRD1O95696 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRD1O95696 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRD1O95696 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRD1O95696 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRD1O95696 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRD1O95696 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRD1O95696 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRD1O95696 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRD1O95696 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRD1O95696 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRD1O95696 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRD1O95696 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRD1O95696 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BRD1O95696 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRD1O95696 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRD1O95696 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms