Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG7O95352 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG7O95352 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG7O95352 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG7O95352 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG7O95352 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG7O95352 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG7O95352 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG7O95352 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG7O95352 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG7O95352 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG7O95352 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG7O95352 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG7O95352 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG7O95352 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG7O95352 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG7O95352 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG7O95352 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG7O95352 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG7O95352 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG7O95352 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG7O95352 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG7O95352 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG7O95352 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG7O95352 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG7O95352 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG7O95352 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG7O95352 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG7O95352 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG7O95352 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG7O95352 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG7O95352 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG7O95352 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG7O95352 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG7O95352 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG7O95352 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG7O95352 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG7O95352 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG7O95352 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG7O95352 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG7O95352 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG7O95352 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG7O95352 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG7O95352 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG7O95352 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG7O95352 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG7O95352 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG7O95352 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG7O95352 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG7O95352 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG7O95352 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG7O95352 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG7O95352 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG7O95352 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG7O95352 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG7O95352 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG7O95352 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG7O95352 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG7O95352 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG7O95352 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG7O95352 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG7O95352 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG7O95352 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG7O95352 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG7O95352 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG7O95352 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG7O95352 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG7O95352 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG7O95352 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG7O95352 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG7O95352 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG7O95352 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG7O95352 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG7O95352 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG7O95352 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG7O95352 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG7O95352 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG7O95352 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG7O95352 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG7O95352 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG7O95352 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG7O95352 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG7O95352 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG7O95352 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG7O95352 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG7O95352 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG7O95352 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG7O95352 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG7O95352 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG7O95352 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG7O95352 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG7O95352 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG7O95352 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG7O95352 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG7O95352 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG7O95352 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG7O95352 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG7O95352 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG7O95352 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG7O95352 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms