Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL18O94889 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms