Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLIT2O94813 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLIT2O94813 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms