Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BBOX1O75936 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
BBOX1O75936 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms