Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RASSF9O75901 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms