Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EIF3JO75822 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3JO75822 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms