Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPS6KA4O75676 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPS6KA4O75676 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPS6KA4O75676 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms