Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCATO75600 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCATO75600 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCATO75600 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCATO75600 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCATO75600 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCATO75600 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCATO75600 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCATO75600 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCATO75600 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GCATO75600 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCATO75600 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCATO75600 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCATO75600 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCATO75600 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCATO75600 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GCATO75600 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCATO75600 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCATO75600 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCATO75600 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCATO75600 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCATO75600 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCATO75600 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCATO75600 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCATO75600 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCATO75600 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCATO75600 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCATO75600 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCATO75600 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCATO75600 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GCATO75600 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCATO75600 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCATO75600 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCATO75600 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCATO75600 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCATO75600 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCATO75600 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCATO75600 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GCATO75600 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCATO75600 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCATO75600 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GCATO75600 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCATO75600 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCATO75600 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCATO75600 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCATO75600 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GCATO75600 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCATO75600 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCATO75600 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GCATO75600 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCATO75600 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCATO75600 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCATO75600 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCATO75600 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCATO75600 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCATO75600 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCATO75600 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GCATO75600 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCATO75600 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCATO75600 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCATO75600 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCATO75600 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCATO75600 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCATO75600 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCATO75600 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCATO75600 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCATO75600 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCATO75600 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCATO75600 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCATO75600 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCATO75600 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCATO75600 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCATO75600 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCATO75600 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCATO75600 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCATO75600 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCATO75600 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCATO75600 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCATO75600 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCATO75600 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCATO75600 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCATO75600 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCATO75600 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCATO75600 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCATO75600 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCATO75600 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCATO75600 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCATO75600 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCATO75600 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCATO75600 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCATO75600 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCATO75600 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCATO75600 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCATO75600 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCATO75600 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCATO75600 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GCATO75600 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCATO75600 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCATO75600 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCATO75600 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms