Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP12O75317 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP12O75317 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP12O75317 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP12O75317 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP12O75317 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP12O75317 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP12O75317 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP12O75317 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP12O75317 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP12O75317 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP12O75317 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP12O75317 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP12O75317 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP12O75317 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP12O75317 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP12O75317 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP12O75317 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP12O75317 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP12O75317 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP12O75317 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP12O75317 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP12O75317 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP12O75317 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP12O75317 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP12O75317 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP12O75317 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP12O75317 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP12O75317 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP12O75317 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP12O75317 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP12O75317 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP12O75317 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP12O75317 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP12O75317 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP12O75317 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP12O75317 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP12O75317 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP12O75317 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP12O75317 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP12O75317 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP12O75317 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP12O75317 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP12O75317 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP12O75317 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP12O75317 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP12O75317 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP12O75317 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP12O75317 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP12O75317 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP12O75317 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP12O75317 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP12O75317 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP12O75317 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP12O75317 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP12O75317 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP12O75317 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP12O75317 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP12O75317 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP12O75317 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP12O75317 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP12O75317 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP12O75317 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP12O75317 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP12O75317 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP12O75317 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP12O75317 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP12O75317 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP12O75317 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP12O75317 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP12O75317 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP12O75317 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP12O75317 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP12O75317 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP12O75317 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP12O75317 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP12O75317 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP12O75317 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP12O75317 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP12O75317 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP12O75317 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP12O75317 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP12O75317 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP12O75317 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP12O75317 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP12O75317 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP12O75317 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP12O75317 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP12O75317 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP12O75317 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP12O75317 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP12O75317 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP12O75317 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP12O75317 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP12O75317 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP12O75317 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP12O75317 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP12O75317 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP12O75317 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP12O75317 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms