Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRP5O75197 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRP5O75197 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRP5O75197 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRP5O75197 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRP5O75197 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRP5O75197 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRP5O75197 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRP5O75197 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRP5O75197 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRP5O75197 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRP5O75197 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRP5O75197 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LRP5O75197 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRP5O75197 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LRP5O75197 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRP5O75197 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRP5O75197 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRP5O75197 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRP5O75197 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRP5O75197 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRP5O75197 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRP5O75197 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRP5O75197 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRP5O75197 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRP5O75197 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRP5O75197 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRP5O75197 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRP5O75197 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRP5O75197 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRP5O75197 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRP5O75197 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LRP5O75197 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRP5O75197 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRP5O75197 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRP5O75197 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRP5O75197 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRP5O75197 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRP5O75197 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRP5O75197 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRP5O75197 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRP5O75197 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRP5O75197 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRP5O75197 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRP5O75197 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRP5O75197 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRP5O75197 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRP5O75197 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRP5O75197 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRP5O75197 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRP5O75197 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRP5O75197 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRP5O75197 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRP5O75197 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRP5O75197 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRP5O75197 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRP5O75197 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRP5O75197 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRP5O75197 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LRP5O75197 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRP5O75197 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRP5O75197 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRP5O75197 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRP5O75197 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRP5O75197 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRP5O75197 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRP5O75197 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRP5O75197 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRP5O75197 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LRP5O75197 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRP5O75197 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRP5O75197 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRP5O75197 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRP5O75197 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRP5O75197 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRP5O75197 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRP5O75197 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRP5O75197 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRP5O75197 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRP5O75197 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRP5O75197 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRP5O75197 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRP5O75197 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRP5O75197 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRP5O75197 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRP5O75197 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRP5O75197 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRP5O75197 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRP5O75197 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRP5O75197 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LRP5O75197 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LRP5O75197 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRP5O75197 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRP5O75197 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRP5O75197 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRP5O75197 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRP5O75197 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRP5O75197 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRP5O75197 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRP5O75197 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms