Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP9AO75110 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms