Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC22O60826 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms