Protein–RNA interactions for Protein: O60635

TSPAN1, Tetraspanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN1O60635 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN1O60635 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN1O60635 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN1O60635 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN1O60635 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN1O60635 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN1O60635 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN1O60635 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN1O60635 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN1O60635 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN1O60635 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN1O60635 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN1O60635 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN1O60635 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN1O60635 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms