Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNG3O60359 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG3O60359 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms