Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAK2O60296 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms