Protein–RNA interactions for Protein: O43639

NCK2, Cytoplasmic protein NCK2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK2O43639 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCK2O43639 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCK2O43639 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCK2O43639 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCK2O43639 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCK2O43639 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCK2O43639 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCK2O43639 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NCK2O43639 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NCK2O43639 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCK2O43639 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCK2O43639 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCK2O43639 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NCK2O43639 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCK2O43639 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCK2O43639 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCK2O43639 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCK2O43639 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCK2O43639 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCK2O43639 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCK2O43639 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCK2O43639 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCK2O43639 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCK2O43639 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCK2O43639 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCK2O43639 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCK2O43639 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCK2O43639 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCK2O43639 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCK2O43639 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCK2O43639 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCK2O43639 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCK2O43639 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCK2O43639 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCK2O43639 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCK2O43639 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NCK2O43639 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCK2O43639 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NCK2O43639 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCK2O43639 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCK2O43639 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCK2O43639 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCK2O43639 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCK2O43639 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCK2O43639 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCK2O43639 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCK2O43639 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCK2O43639 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCK2O43639 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCK2O43639 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCK2O43639 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCK2O43639 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCK2O43639 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCK2O43639 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCK2O43639 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCK2O43639 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCK2O43639 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCK2O43639 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCK2O43639 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCK2O43639 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCK2O43639 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCK2O43639 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCK2O43639 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCK2O43639 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCK2O43639 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCK2O43639 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NCK2O43639 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCK2O43639 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCK2O43639 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCK2O43639 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCK2O43639 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NCK2O43639 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCK2O43639 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCK2O43639 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCK2O43639 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCK2O43639 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCK2O43639 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NCK2O43639 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCK2O43639 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCK2O43639 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCK2O43639 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NCK2O43639 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCK2O43639 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCK2O43639 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCK2O43639 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCK2O43639 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCK2O43639 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NCK2O43639 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCK2O43639 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NCK2O43639 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCK2O43639 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCK2O43639 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCK2O43639 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCK2O43639 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCK2O43639 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCK2O43639 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCK2O43639 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCK2O43639 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCK2O43639 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCK2O43639 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms