Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP2AO43633 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms