Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DYNC1LI2O43237 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DYNC1LI2O43237 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms