Protein–RNA interactions for Protein: O15427

SLC16A3, Monocarboxylate transporter 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A3O15427 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC16A3O15427 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC16A3O15427 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms