Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM6BO15054 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM6BO15054 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC34.36■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms