Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
APAF1O14727 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
APAF1O14727 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
APAF1O14727 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
APAF1O14727 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
APAF1O14727 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APAF1O14727 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
APAF1O14727 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APAF1O14727 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
APAF1O14727 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APAF1O14727 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
APAF1O14727 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APAF1O14727 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APAF1O14727 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
APAF1O14727 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
APAF1O14727 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APAF1O14727 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
APAF1O14727 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APAF1O14727 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
APAF1O14727 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
APAF1O14727 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
APAF1O14727 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
APAF1O14727 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
APAF1O14727 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
APAF1O14727 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
APAF1O14727 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
APAF1O14727 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
APAF1O14727 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
APAF1O14727 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
APAF1O14727 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
APAF1O14727 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
APAF1O14727 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
APAF1O14727 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
APAF1O14727 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
APAF1O14727 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APAF1O14727 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APAF1O14727 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APAF1O14727 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
APAF1O14727 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
APAF1O14727 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
APAF1O14727 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
APAF1O14727 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APAF1O14727 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APAF1O14727 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
APAF1O14727 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
APAF1O14727 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
APAF1O14727 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
APAF1O14727 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
APAF1O14727 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
APAF1O14727 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
APAF1O14727 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
APAF1O14727 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
APAF1O14727 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
APAF1O14727 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
APAF1O14727 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
APAF1O14727 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
APAF1O14727 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
APAF1O14727 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
APAF1O14727 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
APAF1O14727 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
APAF1O14727 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
APAF1O14727 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
APAF1O14727 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
APAF1O14727 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
APAF1O14727 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
APAF1O14727 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
APAF1O14727 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
APAF1O14727 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
APAF1O14727 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
APAF1O14727 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
APAF1O14727 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
APAF1O14727 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
APAF1O14727 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
APAF1O14727 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APAF1O14727 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
APAF1O14727 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
APAF1O14727 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APAF1O14727 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APAF1O14727 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APAF1O14727 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
APAF1O14727 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
APAF1O14727 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
APAF1O14727 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
APAF1O14727 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
APAF1O14727 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
APAF1O14727 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
APAF1O14727 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
APAF1O14727 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
APAF1O14727 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
APAF1O14727 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
APAF1O14727 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
APAF1O14727 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
APAF1O14727 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
APAF1O14727 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APAF1O14727 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
APAF1O14727 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
APAF1O14727 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APAF1O14727 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APAF1O14727 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
APAF1O14727 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms