Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM38O00635 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM38O00635 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms