Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PODXLO00592 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PODXLO00592 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PODXLO00592 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PODXLO00592 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PODXLO00592 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PODXLO00592 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PODXLO00592 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PODXLO00592 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PODXLO00592 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PODXLO00592 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PODXLO00592 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PODXLO00592 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PODXLO00592 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PODXLO00592 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PODXLO00592 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PODXLO00592 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PODXLO00592 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PODXLO00592 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PODXLO00592 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PODXLO00592 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PODXLO00592 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PODXLO00592 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PODXLO00592 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PODXLO00592 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PODXLO00592 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PODXLO00592 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PODXLO00592 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PODXLO00592 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PODXLO00592 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PODXLO00592 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PODXLO00592 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PODXLO00592 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PODXLO00592 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PODXLO00592 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PODXLO00592 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PODXLO00592 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PODXLO00592 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PODXLO00592 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PODXLO00592 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PODXLO00592 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PODXLO00592 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PODXLO00592 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PODXLO00592 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PODXLO00592 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PODXLO00592 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PODXLO00592 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PODXLO00592 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PODXLO00592 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PODXLO00592 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PODXLO00592 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PODXLO00592 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PODXLO00592 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PODXLO00592 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PODXLO00592 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PODXLO00592 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PODXLO00592 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PODXLO00592 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PODXLO00592 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PODXLO00592 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PODXLO00592 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PODXLO00592 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PODXLO00592 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PODXLO00592 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PODXLO00592 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PODXLO00592 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PODXLO00592 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PODXLO00592 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PODXLO00592 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PODXLO00592 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PODXLO00592 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PODXLO00592 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PODXLO00592 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PODXLO00592 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PODXLO00592 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PODXLO00592 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PODXLO00592 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PODXLO00592 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PODXLO00592 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PODXLO00592 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PODXLO00592 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PODXLO00592 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PODXLO00592 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PODXLO00592 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PODXLO00592 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PODXLO00592 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PODXLO00592 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PODXLO00592 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PODXLO00592 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PODXLO00592 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PODXLO00592 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PODXLO00592 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PODXLO00592 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PODXLO00592 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PODXLO00592 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PODXLO00592 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PODXLO00592 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PODXLO00592 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PODXLO00592 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PODXLO00592 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms