Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOLIM4O00461 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOLIM4O00461 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOLIM4O00461 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLIM4O00461 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLIM4O00461 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLIM4O00461 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLIM4O00461 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLIM4O00461 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLIM4O00461 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLIM4O00461 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLIM4O00461 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLIM4O00461 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLIM4O00461 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLIM4O00461 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLIM4O00461 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLIM4O00461 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLIM4O00461 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLIM4O00461 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLIM4O00461 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLIM4O00461 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GOLIM4O00461 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLIM4O00461 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLIM4O00461 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLIM4O00461 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLIM4O00461 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLIM4O00461 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLIM4O00461 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLIM4O00461 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLIM4O00461 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLIM4O00461 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLIM4O00461 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLIM4O00461 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLIM4O00461 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLIM4O00461 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLIM4O00461 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLIM4O00461 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLIM4O00461 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLIM4O00461 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLIM4O00461 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLIM4O00461 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLIM4O00461 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLIM4O00461 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms