Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3CDO00329 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3CDO00329 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms