Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNAP23O00161 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNAP23O00161 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms