Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms