Protein–RNA interactions for Protein: F8VRH5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VRH5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8VRH5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8VRH5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8VRH5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8VRH5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8VRH5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8VRH5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8VRH5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8VRH5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8VRH5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8VRH5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8VRH5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
F8VRH5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F8VRH5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F8VRH5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F8VRH5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
F8VRH5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
F8VRH5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F8VRH5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
F8VRH5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
F8VRH5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
F8VRH5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
F8VRH5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
F8VRH5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
F8VRH5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
F8VRH5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
F8VRH5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F8VRH5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F8VRH5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F8VRH5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F8VRH5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F8VRH5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F8VRH5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F8VRH5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
F8VRH5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F8VRH5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
F8VRH5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F8VRH5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F8VRH5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F8VRH5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F8VRH5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F8VRH5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F8VRH5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F8VRH5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F8VRH5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F8VRH5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F8VRH5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F8VRH5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F8VRH5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F8VRH5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F8VRH5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F8VRH5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F8VRH5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
F8VRH5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F8VRH5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F8VRH5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F8VRH5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F8VRH5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F8VRH5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F8VRH5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F8VRH5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F8VRH5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F8VRH5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F8VRH5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
F8VRH5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F8VRH5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F8VRH5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F8VRH5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
F8VRH5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F8VRH5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F8VRH5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F8VRH5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F8VRH5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F8VRH5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F8VRH5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F8VRH5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F8VRH5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F8VRH5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F8VRH5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F8VRH5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F8VRH5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
F8VRH5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F8VRH5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F8VRH5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F8VRH5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F8VRH5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F8VRH5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F8VRH5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F8VRH5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F8VRH5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F8VRH5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F8VRH5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F8VRH5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F8VRH5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F8VRH5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F8VRH5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F8VRH5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F8VRH5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F8VRH5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F8VRH5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms