Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO7DNF2Z398 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO7DNF2Z398 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO7DNF2Z398 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO7DNF2Z398 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO7DNF2Z398 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO7DNF2Z398 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO7DNF2Z398 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO7DNF2Z398 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO7DNF2Z398 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO7DNF2Z398 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO7DNF2Z398 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO7DNF2Z398 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO7DNF2Z398 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms