Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms