Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP99D6REC4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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