Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DIRC3C9JPN6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DIRC3C9JPN6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DIRC3C9JPN6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DIRC3C9JPN6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DIRC3C9JPN6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DIRC3C9JPN6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DIRC3C9JPN6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DIRC3C9JPN6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DIRC3C9JPN6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DIRC3C9JPN6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DIRC3C9JPN6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DIRC3C9JPN6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DIRC3C9JPN6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DIRC3C9JPN6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DIRC3C9JPN6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DIRC3C9JPN6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DIRC3C9JPN6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DIRC3C9JPN6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DIRC3C9JPN6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DIRC3C9JPN6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DIRC3C9JPN6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DIRC3C9JPN6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms