Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 462.8 ms